lncRNA
在之前的分享中小編給大家介紹過非編碼 RNA 家族中的 circRNA , 如果說 circRNA 是目前生物學研究領域的流量擔當，那 lncRNA 應是紅遍大江南北了。從 lncRNA 歷年文獻發(fā)表情況和近十年國自然相關項目數(shù)據(jù)可以看出，lncRNA 在科研領域中熱度年年攀升，并且高熱不減。lncRNA 可以通過影響染色質(zhì)結構和轉(zhuǎn)錄因子占位、表觀遺傳學、以序列和結構特異性結合生物大分子等機制調(diào)節(jié)基因表達，在發(fā)育、機體內(nèi)平衡和維持細胞命運中發(fā)揮重要作用，lncRNA 的異常表達與包括癌癥在內(nèi)的多種疾病密切相關。隨著高通量測序、lncRNA 芯片等技術的發(fā)展，越來越多的 lncRNA 被鑒定出來，但具體的作用與功能仍然不是很清楚，因此 lncRNA 的研究前景依然是十分廣闊的，具有極大的研究價值。今天就與大家分享兩篇新鮮出爐的 lncRNA 研究。
lncRNA 歷年文獻發(fā)表情況
近十年國自然 lncRNA 相關項目數(shù)據(jù)
文章展示
長非編碼 RNA PGM5-AS1 通過削弱 miR-140-5p 介導的 FBN1 抑制，促進骨肉瘤細胞的上皮 - 間質(zhì)轉(zhuǎn)化，侵襲和轉(zhuǎn)移
Long non-coding RNA PGM5-AS1 promotes epithelial-mesenchymal transition, invasion and metastasis of osteosarcoma cells by impairing miR-140-5p-mediated FBN1 inhibition
期刊：Mol Oncol
發(fā)表時間：2020 May 15
影響因子：5.962
單位：吉林省第一醫(yī)院
摘要：骨肉瘤是一種罕見的骨腫瘤，近年來發(fā)病率升高，愈合率低；上皮 - 間質(zhì)轉(zhuǎn)化（EMT）是解釋骨肉瘤和其他癌癥的侵襲和轉(zhuǎn)移的概念范例。因此，制定有效的治療策略來治療骨肉瘤的 EMT 是至關重要的。研究確定了長非編碼 RNA（lncRNA）PGM5-AS1 在 EMT 和骨肉瘤進展中的分子機制；基于微陣列的分析用于篩選骨肉瘤相關的差異表達的 lncRNA；測定骨肉瘤組織和細胞中 PGM5-AS1 以及 microRNA-140-5p（miR-140-5p）和原纖維蛋白 -1（FBN1）的水平；熒光素報告系統(tǒng)確認結合片段，RNA pull-down 實驗和 RNA 蛋白免疫沉淀實驗以驗證 PGM5-AS1，miR-140-5p 和 FBN1 之間的關系。通過過表達、shRNA、模擬物或抑制劑改變 PGM5-AS1、miR-140-5p 和 FBN1 的表達，以探討它們在體外如何調(diào)節(jié)骨肉瘤細胞的轉(zhuǎn)移、侵襲和 EMT。在裸鼠體內(nèi)采用功能喪失和功能增強的方法檢測它們在體內(nèi)腫瘤發(fā)生中的作用，發(fā)現(xiàn)骨肉瘤組織和細胞表達較低，但 PGM5-AS1 和 FBN1 表達較高；PGM5-AS1 與 miR-140-5p 競爭性結合以上調(diào) FBN1。此外，阻礙 PGM5-AS1 和 FBN1 或過表達 miR-140-5p 在體外抑制骨肉瘤細胞的轉(zhuǎn)移，侵襲和 EMT。此外，沉默 PGM5-AS1 或 FBN1 或過表達 miR-140-5p 顯著抑制裸鼠體內(nèi)的腫瘤發(fā)生。綜上所述，PGM5-AS1 消耗導致 FBN1 減少，通過負調(diào)節(jié) miR-140-5p 來延緩骨肉瘤過程。
PGM5-AS1 在骨肉瘤細胞過程中的調(diào)節(jié)機制
SMAD4 激活 Wnt 信號通路抑制顆粒細胞凋亡
SMAD4 activates Wnt signaling pathway to inhibit granulosa cell apoptosis
期刊：Cell Death & Disease
發(fā)表時間：2020 May 15
影響因子：5.595
單位：南京農(nóng)業(yè)大學
摘要：TGF- β 和 Wnt 信號通路在許多細胞類型和組織中相互關聯(lián)，并協(xié)調(diào)控制細胞功能。這篇文章中，報道了 TGF- β 信號通路的下游效應因子 SMAD4 誘導 Wnt 信號通路的受體 FZD4，建立了顆粒細胞（GCs) 中這兩條通路之間的新的途徑。研究者發(fā)現(xiàn) SMAD4 是 FZD4 的強誘導劑，不僅啟動 FZD4 轉(zhuǎn)錄，而且激活 FZD4 依賴的 Wnt 信號和 GC 凋亡。研究者確定了 SMAD4 促進 GC 中 FZD4 表達的直接和間接機制；SMAD4 促進 SDNOR 的產(chǎn)生，SDNOR 是一種新的 lncRNA，作為 miR-29c 的海綿，提供了另一種阻止 miR-29c 退化 FZD4mRNA 的手段。該研究不僅揭示了 TGF- β 和 Wnt 信號通路 SMAD4-FZD4 軸之間的一個新的串擾通道，而且為 GC 凋亡和卵泡閉鎖的調(diào)控網(wǎng)絡提供了新的見解：這些 RNA 分子，如 miR-29c 和 lnc-SDNOR，是治療生殖疾病和提高女性生育能力的潛在靶點。
SMAD4 保護 FZD4 的原理模型
研究思路
前期高通量和數(shù)據(jù)分析，后期功能分子實驗檢驗（敲除過表達、熒光素酶報告系統(tǒng)、染色質(zhì)免疫沉淀等）。
lncRNA 機制研究如何 get 高分
lncRNA 的機制研究相當困難，主要實驗過程復雜，實驗量巨大，如果想發(fā)超 10 分的高分文章并且有好的研究思路可以從這個角度探索。其實我們可以換個角度研究 lncRNA，不要將 lncRNA 作為一個調(diào)節(jié)分子；而是把 lncRNA 當做和 mRNA 一樣的分子來研究。在體外，可以通過分子干擾手段，進行分子及表型研究；在體內(nèi)，也是如此。兩者通過各種組合，也能輕松 get 一篇 5 分以上的文章。
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