上圖中節(jié)點的大小表示的是基因的 degree，顏色代表上下調(diào)的信息，邊的顏色或者線型代表是相互作用的來源。
轉(zhuǎn)錄因子分析及網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建介紹
轉(zhuǎn)錄因子與基因表達調(diào)控區(qū)域的特異性結(jié)合是基因表達的重要調(diào)控方式。針對特定轉(zhuǎn)錄因子的實驗，可對差異基因進行轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點的 motif 分析，從而推測差異基因中有哪些基因可能直接受該轉(zhuǎn)錄因子調(diào)節(jié)。后結(jié)果會用統(tǒng)計學(xué)方法進行檢驗，找到調(diào)控目標(biāo)生物性狀，統(tǒng)計學(xué)上有顯著差別的轉(zhuǎn)錄因子。找到差異的轉(zhuǎn)錄因子及其調(diào)控的靶基因，我們可以構(gòu)建 TF-network，從中得出關(guān)鍵的轉(zhuǎn)錄因子及被關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子轉(zhuǎn)錄調(diào)控的基因，系統(tǒng)的研究轉(zhuǎn)錄因子與基因的調(diào)控關(guān)系。
客戶關(guān)注的 mRNA,lncRNA,microRNA（如差異基因）。
1、圖片文件（Network 圖），包括 png,PDF 格式；
2、Cytocape 文件：可以 cytoscape 打開進行細節(jié)調(diào)整；
3、文本文件：轉(zhuǎn)錄因子與基因之間的調(diào)控關(guān)系，結(jié)合 score 值，Evalue，以及關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子的排序。
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