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        伯豪生物
        單細(xì)胞核 RNA 測(cè)序
         電子資料 調(diào)研問卷

        技術(shù)簡(jiǎn)介

        伯豪生物官網(wǎng) www.ukdirect.cn 新消息 單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)服務(wù)來了

        伯豪生物單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(single-nucleus RNA sequencing,snRNA-seq)是從組織抽提細(xì)胞核,然后在單個(gè)細(xì)胞核水平上對(duì)轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行高通量測(cè)序分析的一項(xiàng)新技術(shù),通過檢測(cè)單個(gè)細(xì)胞核的基因表達(dá)狀態(tài),進(jìn)而揭示細(xì)胞間的異質(zhì)性。

        伯豪生物提供:?jiǎn)渭?xì)胞核測(cè)序、單細(xì)胞核測(cè)序技術(shù)服務(wù)

        實(shí)驗(yàn)流程

        伯豪生物單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序科研流程圖

        伯豪生物提供:?jiǎn)渭?xì)胞核測(cè)序、單細(xì)胞核測(cè)序技術(shù)服務(wù)

        冷凍樣本和難消化樣本的解決方案

        1、適用于凍存組織樣品;克服新鮮樣品時(shí)效性限制;

        2、適用于難以制備單細(xì)胞懸液的組織樣品;

        3、減少解離偏差,能更好地保留細(xì)胞類型多樣性;

        4、不需要酶促消化,真實(shí)反映細(xì)胞的組分。

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        伯豪優(yōu)勢(shì)

        1、高質(zhì)量抽核:抽核經(jīng)驗(yàn)豐富,針對(duì)不同組織優(yōu)化了解決方案;

        2、標(biāo)準(zhǔn)化內(nèi)控:豐富的實(shí)操經(jīng)驗(yàn)構(gòu)建了標(biāo)準(zhǔn)化的內(nèi)控體系;

        3、流程化分析:完善的分析流程,準(zhǔn)確快速解析單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù);

        4、專業(yè)的團(tuán)隊(duì):專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì)具有多年項(xiàng)目方案設(shè)計(jì)、實(shí)驗(yàn)操作、售后分析等經(jīng)驗(yàn);

        5、全流程服務(wù):提供組織抽核、單細(xì)胞核捕獲、反轉(zhuǎn)錄、建庫測(cè)序及數(shù)據(jù)分析的全套服務(wù)。

        伯豪生物提供:?jiǎn)渭?xì)胞核測(cè)序、單細(xì)胞核測(cè)序技術(shù)服務(wù)

        樣本要求

        1、組織用量:黃豆粒大小 1 塊;

        2、樣本處理:組織液氮速凍,-80℃保存;

        3、質(zhì)量要求:組織 RNA 無降解,RIN≥7;

        4、運(yùn)輸方式:干冰運(yùn)輸。

        伯豪生物提供:?jiǎn)渭?xì)胞核測(cè)序、單細(xì)胞核測(cè)序技術(shù)服務(wù)

        應(yīng)用領(lǐng)域

        冷凍樣本;FFPE 樣本; 通過消化難拿到高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液的組織類型。

        伯豪生物提供:?jiǎn)渭?xì)胞核測(cè)序、單細(xì)胞核測(cè)序技術(shù)服務(wù)

        研究成果

        伯豪生物單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)圖 1

        小鼠肝臟單細(xì)胞核

        伯豪生物單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)圖 2


        人松果體單細(xì)胞核

        伯豪生物單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)圖 3


        小鼠大腦皮層單細(xì)胞核

        伯豪生物單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)圖 4

        小鼠心臟組織細(xì)胞核 RNA 質(zhì)檢(RIN=8.9)

        伯豪生物單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)圖 5

        PCR 驗(yàn)證組織與細(xì)胞核、組織與消化細(xì)胞的差別(0 為相同)

        結(jié)論:

        小鼠大腦皮層,相比于消化細(xì)胞,細(xì)胞核的表達(dá)情況更接近于原始組織樣本。

        伯豪生物提供:?jiǎn)渭?xì)胞核測(cè)序、單細(xì)胞核測(cè)序技術(shù)服務(wù)

        【單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序】VS【單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序】結(jié)果對(duì)比

        1、隨著測(cè)序深度的不斷增加,單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(snRNA-seq)和單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(scRNA-seq)得到的基因數(shù)相近。

        伯豪生物單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)圖 6

        Single-cell DropSeq scDropSeq


        2、單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序在細(xì)胞分群上與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序沒有區(qū)別

        伯豪生物單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)圖 7

        單細(xì)胞核數(shù)據(jù)分群結(jié)果                                     單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分群結(jié)果

        3、單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序可有效挖掘稀有細(xì)胞類型

        伯豪生物單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)圖 8

        單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序可以減少組織消化引起的偏差


        4、單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果中發(fā)現(xiàn)較少壓力相關(guān)基因的表達(dá)

        伯豪生物單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)圖 9

        參考文獻(xiàn)

        [1]Habib, Naomi, Avraham-Davidi, Inbal, Basu, Anindita, et al. Massively parallel single-nucleus RNA-seq with DroNc-seq[J]. Nature Methods, 2017, 14(10):955-958.

        [2] Wu, Haojia, Kirita, Yuhei, Donnelly, Erinn L, 等。Advantages of Single-Nucleus over Single-Cell RNA Sequencing of Adult Kidney: Rare Cell Types and Novel Cell States Revealed in Fibrosis[J]. Journal of the American Society of Nephrology, 2018.


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