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        伯豪生物
        分子建模預測

        Demo 結果

        demo 分析結果圖

        demo 結果分析圖 2

        結果解讀

        選用了目前主流的分類器(比如 SVM,KNN)以及篩選特征值的方法(貪婪算法)篩選并建立穩(wěn)定的模型,幫助客戶篩選到靈敏度與特異性高的 maker。


        分子建模預測

        采用模式識別與數(shù)據(jù)挖掘技術有效進行模型的構建,將部分數(shù)據(jù)拿來做訓練集預測模型,然后部分數(shù)據(jù)作為測試數(shù)據(jù)集(獨立樣本)來驗證模型的準確性。目的在于利用實驗數(shù)據(jù)來篩選出一批靶標基因,并以此構建模型。小樣本數(shù)據(jù)的建模在于篩選并評判 maker 的穩(wěn)定性,便于后期實驗驗證;大樣本數(shù)據(jù)的建模用于進行早期診斷、疾病預測。采用方法分為:線性分類器以及非線性分類器,并利用了 Leave-one-out cross-validation(LOOCV)以及 cross-validated misclassification error rate 的篩選策略找到優(yōu)選 MARKER。

        分析要求

        1、小樣本建模:樣本數(shù)在 20 以上;

        2、大樣本建模:樣本數(shù)在 100 以上;

        3、數(shù)據(jù)類型:表達,甲基化,CNV,SNP 均可。

        提供結果

        1、圖片格式:ROC 曲線圖,TIFF 格式;

        2、文本文件:樣本的分類情況,靈敏度與特異性,maker 的權重(線性分類器結果)。

        -END-

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