伯豪學(xué)院

盡管轉(zhuǎn)錄組研究已經(jīng)獲得很多令人激動(dòng)的進(jìn)展，但它終歸還是一個(gè)高度協(xié)調(diào)的、受表觀基因組調(diào)控的基因表達(dá)程序的副產(chǎn)物。表觀基因組是由DNA的染色質(zhì)狀態(tài)決定的，這種狀態(tài)可以是開(kāi)放的（可及的），也可以是封閉的（不可及的）。

空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的出現(xiàn)，使研究人員了解不同轉(zhuǎn)錄本的空間位置信息。但是，目前的技術(shù)還達(dá)不到單細(xì)胞的分辨率水平。

Visium空間轉(zhuǎn)錄組哪些常見(jiàn)問(wèn)題？這里有你想要的答案！盡管問(wèn)，你的答案已經(jīng)打包好！

單細(xì)胞RNA測(cè)序（scRNA-seq）技術(shù)的飛速發(fā)展使人們對(duì)組織中細(xì)胞種類(lèi)、細(xì)胞的特殊狀態(tài)有了深入認(rèn)識(shí)。但是，scRNA-seq對(duì)于器官或者固體組織制備的細(xì)胞懸液的細(xì)胞活性和細(xì)胞數(shù)目有著較高的要求，這也意味著 “躺在”超低溫冰箱中的大量珍貴臨床樣本（腦組織，腫瘤組織等）都無(wú)法進(jìn)行scRNA測(cè)序。而單細(xì)胞核RNA測(cè)序技術(shù)（snRNA-seq）的出現(xiàn)，則在很大程度上解決了以上問(wèn)題。

生命科學(xué)研究技術(shù)在不斷發(fā)展和進(jìn)步，生物學(xué)的研究層面也在不斷拓展，從組織到細(xì)胞再到細(xì)胞的空間分布定位，生命科學(xué)的研究正在進(jìn)行從二維到三維的巨變?？臻g轉(zhuǎn)錄組是這一轉(zhuǎn)變的引領(lǐng)者之一。

人類(lèi)細(xì)胞圖譜計(jì)劃，旨在繪制人體的每一種細(xì)胞類(lèi)型。人類(lèi)心臟圖譜的相關(guān)數(shù)據(jù)公布在國(guó)際尖端期刊《Nature》上。該研究利用10x Genomics技術(shù)，對(duì)健康人心臟的近50萬(wàn)個(gè)單細(xì)胞進(jìn)行了測(cè)序分析，構(gòu)建了迄今為止較為廣泛的人類(lèi)心臟細(xì)胞圖譜。

腸道生態(tài)環(huán)境的改變與人類(lèi)健康與疾病顯著相關(guān)。腸道代謝物，包括氨基酸和細(xì)菌代謝物（eg. 膽汁酸和短鏈脂肪酸）與腸癌狀態(tài)有關(guān)。因此，通過(guò)宏基因組和代謝組分析可以為了解腸道環(huán)境的變化與CRC的發(fā)展提供方法。

轉(zhuǎn)眼9月已經(jīng)過(guò)去，小編在這里為大家精心上收集了以DNA甲基化研究為主題的新研究成果，截止現(xiàn)在，9月以DNA methylation為關(guān)鍵詞檢索到的文獻(xiàn)一共有603篇，小編在這里為大家精心挑選了以下6篇作為重點(diǎn)分享。

現(xiàn)在很多的研究同時(shí)進(jìn)行Bulk RNA-seq 和single cell RNA-seq，為了明確單細(xì)胞測(cè)序分析結(jié)果的準(zhǔn)確性，可以利用相同樣本的 Bulk RNA-Seq 數(shù)據(jù)進(jìn)行評(píng)估，兩種測(cè)序結(jié)果相互印證。

九月份單細(xì)胞測(cè)序相關(guān)文獻(xiàn)共收集到48篇（IF>9），文末列表中列出文獻(xiàn)發(fā)表期刊、研究方向和技術(shù)平臺(tái)等信息，接下來(lái)先看看其中6篇。